Racines anciennes : une explosion cambrienne des genes de susceptibilite a l'autisme

Titre original en anglais : Ancient roots: A Cambrian explosion of autism susceptibility genes

Cette publication est incluse dans le projet « Contributions académiques de personnes autistes sur l’autisme ». un auteur·ice de cette publication est identifié·e comme autiste dans le projet.

À propos de la mention auteur·ice autiste

Casanova, E. (2023). Ancient roots: A Cambrian explosion of autism susceptibility genes. Autism Research, 16(8), 1480-1487. https://doi.org/10.1002/aur.2984

Publication date: 08/07/2023 Ajout dans AutiHub: 14/09/2026 Type: Article Langue de l’article: Anglais

Cette publication est intégrée dans AutiHub via :

Auteurs

Auteur·ices des publications
1
Auteur·ices de la publication identifié·es comme autistes
1 / 1 (100,0 %)

Résumé

Resume Les groupes fonctionnels de genes partagent souvent des profils evolutifs uniques. La presente etude examine si les genes de susceptibilite a l'autisme, qui presentent frequemment un chevauchement fonctionnel, affichent des profils inhabituels d'age des genes et de conservation par rapport a d'autres groupes de genes. A l'aide de donnees phylostratigraphiquement derivees et d'autres donnees genetiques, l'auteur explore l'age moyen des genes, le statut d'ohnologue, le taux evolutif, l'intolerance a la variation et le nombre d'interactions proteine-proteine (PPI) parmi les groupes de genes de susceptibilite a l'autisme, du systeme nerveux, de regulation du developpement, immunitaires, domestiques et de luxe. Les genes de susceptibilite a l'autisme sont inhabituellement anciens par rapport aux temoins, de nombreux genes ayant subi une radiation au cours de la periode cambrienne chez les premiers vertebres a la suite d'evenements de duplication du genome entier. Ils sont egalement etroitement conserves dans l'ensemble du regne animal, presentent une forte intolerance a la variation et comptent davantage de PPI que les autres genes, autant de caracteristiques suggerant une sensibilite extreme au dosage. Les resultats de la presente etude indiquent que les genes de susceptibilite a l'autisme presentent des profils uniques de radiation et de conservation, qui pourraient refleter les transitions majeures de l'evolution du systeme nerveux survenant chez les premiers animaux et qui restent aujourd'hui fondamentales dans le developpement cerebral.

Abstract Functional gene groups often share unique evolutionary patterns. The present study addresses whether autism susceptibility genes, which frequently share functional overlap, display unusual gene age and conservation patterns compared to other gene groups. Using phylostratigraphically‐derived and other genetic data, the investigator explores average gene age, Ohnolog status, evolutionary rate, variation intolerance, and numbers of protein–protein (PPI) interactions across autism susceptibility, nervous system, developmental regulatory, immune, housekeeping, and luxury gene groups. Autism susceptibility genes are unusually old compared to controls, many genes having radiated in the Cambrian period in early vertebrates from whole genome duplication events. They are also tightly conserved across the animal kingdom, are highly variation intolerant, and have more PPI than other genes—all features suggesting extreme dosage sensitivity. The results of the current study indicate that autism susceptibility genes display unique radiation and conservation patterns, which may be a reflection of the major transitions in nervous system evolution that were occurring in early animals and which are still foundational in brain development today.

Bibliographie citée par cette référence

Les références citées sont importées depuis des sources externes de métadonnées lorsqu’elles sont disponibles. La liste peut être partielle.

Vue d’ensemble de la bibliographie citée

Ces indicateurs décrivent la bibliographie citée par cette publication. Un nom d’auteurice est compté chaque fois qu’il apparaît dans une référence citée : une même personne peut donc être comptée plusieurs fois. Les noms qui ne sont pas encore associés à un·e auteurice déjà présent·e dans AutiHub sont traités comme inconnus, pas comme non autistes. Dernier calcul : 20/09/2026 01:01.

Références citées
19
Avec un DOI
18
Sans DOI, à partir du texte brut de la bibliographie
1
0 / 19 (0,0 %) références citées comprennent au moins une personne identifiée comme autiste.
Références avec données à compléter
0 / 19 (0,0 %)
Références avec noms d’auteurices détectés
19 / 19 (100,0 %)
Sans nom d’auteurice détecté
0
Sans titre structuré
0
Sans identifiant stable
1
Références avec noms bruts d’auteurices restant à vérifier
0
Références avec problème de récupération des métadonnées externes
0
Ces indicateurs portent sur les références citées affichées sur cette page, après fusion des doublons techniques. Une référence sans DOI peut quand même soutenir les statistiques d’auteurices lorsqu’un titre et des noms d’auteurices sont disponibles.
Noms d’auteurices détectés dans la bibliographie citée
379
À partir du DOI ou de métadonnées externes
379
À partir du texte brut validé de la bibliographie
0
Noms bruts déjà validés
0
Noms bruts restant à vérifier
0
2 / 379 (0,5 %) noms sont associés à un·e auteurice déjà présent·e dans AutiHub. 377 / 379 (99,5 %) noms ne sont pas encore associés.
Noms associés à une personne identifiée comme autiste
0 / 379 (0,0 %)
Calculé sur l’ensemble des noms d’auteurices détectés dans la bibliographie citée. Parmi les noms associés à un·e auteurice déjà présent·e dans AutiHub : 0 / 2 (0,0 %). Personnes distinctes identifiées comme autistes : 0 / 377 (0,0 %).
  1. John Montgomery , David Bodznick (2010). Functional origins of the vertebrate cerebellum from a sensory processing antecedent . Current Zoology, 56(3), 277-284. Oxford University Press (OUP).
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  2. Francisco Aboitiz , Juan F. Montiel (2015). Olfaction, navigation, and the origin of isocortex . Frontiers in Neuroscience, 9, 402-402. Frontiers Media SA.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  3. Luis Puelles , John L. R. Rubenstein (2015). A new scenario of hypothalamic organization: rationale of new hypotheses introduced in the updated prosomeric model . Frontiers in Neuroanatomy, 9, 27-27. Frontiers Media SA.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  4. Eli Eisenberg , Erez Y. Levanon (2013). Human housekeeping genes, revisited . Trends in Genetics, 29(10), 569-574. Elsevier BV.
    Crossref OpenAlex
  5. Brett S Abrahams , Dan E Arking , Daniel B Campbell , Heather C Mefford , Eric M Morrow , Lauren A Weiss et al. (2013). SFARI Gene 2.0: a community-driven knowledgebase for the autism spectrum disorders (ASDs) . Molecular Autism, 4(1), 36. Springer Science and Business Media LLC.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  6. Fred Keijzer , Marc van Duijn , Pamela Lyon (2013). What nervous systems do: early evolution, input–output, and the skin brain thesis . Adaptive Behavior, 21(2), 67-85. SAGE Publications.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  7. Beatriz Albuixech-Crespo , Carlos Herrera-Úbeda , Gemma Marfany , Manuel Irimia , Jordi Garcia-Fernàndez (2017). Origin and evolution of the chordate central nervous system: Insights from amphioxus genoarchitecture . Journal of Developmental Biology, 61(10-11-12), 655. EHU Press.
    Crossref OpenAlex
  8. Fiona Cunningham , James E Allen , Jamie Allen , Jorge Alvarez-Jarreta , M Ridwan Amode , Irina M Armean et al. (2022). Ensembl 2022 . Nucleic Acids Research, 50(D1), D988-D995. Oxford University Press (OUP).
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  9. Brasier M. (1979). The origin of major invertebrate groups: systematics association . The origin of major invertebrate groups: systematics association, 103.
    Type: Autre
    Crossref
  10. Brigitte Galliot , Manon Quiquand , Luiza Ghila , Renaud de Rosa , Marijana Miljkovic-Licina , Simona Chera (2009). Origins of neurogenesis, a cnidarian view . Developmental Biology, 332(1), 2-24. Elsevier BV.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  11. Karin Breuer , Amir K. Foroushani , Matthew R. Laird , Carol Chen , Anastasia Sribnaia , Raymond Lo et al. (2013). InnateDB: systems biology of innate immunity and beyond—recent updates and continuing curation . Nucleic Acids Research, 41(D1), D1228-D1233. Oxford University Press (OUP).
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  12. Konrad J. Karczewski , Laurent C. Francioli , Grace Tiao , Beryl B. Cummings , Jessica Alföldi , Qingbo Wang et al. (2020). The mutational constraint spectrum quantified from variation in 141,456 humans . Nature, 581(7809), 434-443. Springer Science and Business Media LLC.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  13. Takashi Makino , Aoife McLysaght (2010). Ohnologs in the human genome are dosage balanced and frequently associated with disease . Proceedings of the National Academy of Sciences, 107(20), 9270-9274. National Academy of Sciences.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  14. Todd E. Feinberg , Jon Mallatt (2013). The evolutionary and genetic origins of consciousness in the Cambrian Period over 500 million years ago . Frontiers in Psychology, 4, 667-667. Frontiers Media SA.
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  15. Madalina Giurgiu , Julian Reinhard , Barbara Brauner , Irmtraud Dunger-Kaltenbach , Gisela Fobo , Goar Frishman et al. (2019). CORUM: the comprehensive resource of mammalian protein complexes—2019 . Nucleic Acids Research, 47(D1), D559-D563. Oxford University Press (OUP).
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  16. Jacob M. Musser , Klaske J. Schippers , Michael Nickel , Giulia Mizzon , Andrea B. Kohn , Constantin Pape et al. (2021). Profiling cellular diversity in sponges informs animal cell type and nervous system evolution . Science, 374(6568), 717-723. American Association for the Advancement of Science (AAAS).
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  17. Huaiyu Mi , Anushya Muruganujan , Dustin Ebert , Xiaosong Huang , Paul D Thomas (2019). PANTHER version 14: more genomes, a new PANTHER GO-slim and improvements in enrichment analysis tools . Nucleic Acids Research, 47(D1), D419-D426. Oxford University Press (OUP).
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  18. Evgenia V Kriventseva , Dmitry Kuznetsov , Fredrik Tegenfeldt , Mosè Manni , Renata Dias , Felipe A Simão et al. (2019). OrthoDB v10: sampling the diversity of animal, plant, fungal, protist, bacterial and viral genomes for evolutionary and functional annotations of orthologs . Nucleic Acids Research, 47(D1), D807-D811. Oxford University Press (OUP).
    Crossref OpenAlex OpenCitations
  19. Param Priya Singh , Hervé Isambert (2019). Ohnologs v2: A comprehensive resource for the genes retained from whole genome duplication in vertebrates . Nucleic Acids Research, 48(1), D724. openRxiv.
    Type: Prépublication DOI: 10.1101/717124 OpenAlex: https://openalex.org/W2965320044
    Crossref OpenAlex